Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS45Q9NRW7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms