Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP4Q9NRJ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms