Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST12Q9NRB3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms