Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB3Q9NQW8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CNGB3Q9NQW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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