Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPNPEP3Q9NQH7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPNPEP3Q9NQH7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPNPEP3Q9NQH7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XPNPEP3Q9NQH7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms