Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYLDQ9NQC7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
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