Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NRIP3Q9NQ35 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms