Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDH12Q9NPG4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms