Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC4Q9HBW1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms