Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUDS3Q9H7L9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms