Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL3Q9H2J4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms