Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF541Q9H0D2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms