Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC90BQ9GZT6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms