Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
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