Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM6Q9C030 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms