Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP1Q9C000 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms