Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP5Q9BXF6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms