Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms