Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms