Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms