Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms