Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms