Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3R4Q99570 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms