Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

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Length 1,030 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMS19Q96T76 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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