Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A9Q96Q91 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms