Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1AQ96P16 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms