Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms