Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC138Q96M89 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms