Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT74Q96LB3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms