Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CABS1Q96KC9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABS1Q96KC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms