Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms