Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX11Q96FC9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms