Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB2Q96DC9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms