Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RMDN1Q96DB5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RMDN1Q96DB5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RMDN1Q96DB5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RMDN1Q96DB5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RMDN1Q96DB5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RMDN1Q96DB5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RMDN1Q96DB5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms