Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF183Q96D59 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms