Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms