Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms