Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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