Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLP1Q92989 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms