Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms