Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms