Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf3Q8WVX3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms