Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms