Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms