Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms