Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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ZNF548Q8NEK5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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