Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms