Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF1Q8N6C5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms