Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms