Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK2Q8IWQ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms